29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01911 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  82.26 
 
 
179 aa  319  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  57.75 
 
 
177 aa  224  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  52.46 
 
 
177 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  36.76 
 
 
179 aa  134  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  36.07 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  37.85 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  32.97 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  33.71 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  32.8 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  32.96 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  32.26 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  30.48 
 
 
181 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  31.55 
 
 
181 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  32.56 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  29.82 
 
 
184 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  32.54 
 
 
191 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  30.18 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  32.16 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  31.98 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.42 
 
 
180 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.59 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  25.43 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  25.14 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.53 
 
 
597 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.74 
 
 
604 aa  47.8  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  20.24 
 
 
417 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.34 
 
 
604 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  23.89 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>