29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01777 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  83.71 
 
 
442 aa  795    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  931    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.59 
 
 
475 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  34.01 
 
 
451 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  34.1 
 
 
333 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  33.77 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  33.77 
 
 
378 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  33.77 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  33.44 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  33.77 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  34.46 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  33.33 
 
 
330 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  34.1 
 
 
333 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  34.1 
 
 
333 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  33.11 
 
 
333 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  32.29 
 
 
318 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  31.94 
 
 
318 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  32.71 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  32.71 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  31.74 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  30.07 
 
 
334 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
268 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 
252 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.19 
 
 
808 aa  46.6  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.52 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3285  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
363 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 
250 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 
256 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>