33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003439 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 66 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  92.42 
 
 		 83 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  61.54 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  48.94 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  49.15 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  44.23 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  48.89 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  46.81 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  48.89 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  46.81 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  46.81 
 
 		 92 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  48.28 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  56.1 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  42.62 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  56.1 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  44.07 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  56.1 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  59.46 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  56.1 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  43.86 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  43.86 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  59.46 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  55 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  50 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  56.76 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  56.76 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  51.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  38.3 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  42.22 
 
 		 58 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  41.38 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>