17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0388 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  100 
 
 		 125 aa  256  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  72.22 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01140  Tfp pilus assembly protein PilV  57.28 
 
 		 136 aa  95.9  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0667  hypothetical protein  44.88 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  41.38 
 
 		 225 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  30.16 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  34.67 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  58.06 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  30.15 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  40.3 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  34.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  32.88 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  37.88 
 
 		 186 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  31.94 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  31.31 
 
 		 144 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  31.31 
 
 		 144 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>