17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0356 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0356  toxin co-regulated pilus biosynthesis outer membrane protein C  100 
 
 		 489 aa  996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.903554  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  21.69 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  28.19 
 
 		 888 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  28.19 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.19 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  21.83 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.19 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.19 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  28.19 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.19 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  31.43 
 
 		 577 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  20.88 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.71 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.34 
 
 		 559 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  23.47 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  23.47 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  22.45 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>