237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0228 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  82.09 
 
 		 204 aa  342  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  79.1 
 
 		 204 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  78.77 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0884  glutaredoxin  75.14 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  35.11 
 
 		 95 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  38.89 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  37.18 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  40 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  40 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  40 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  41.1 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0909  glutaredoxin 1  35.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  40.79 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  35.37 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1006  glutaredoxin 1  35.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.03 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0977  glutaredoxin 1  35.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0945  glutaredoxin 1  35.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1025  glutaredoxin 1  35.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.934039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  38.16 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  29.7 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0716  glutaredoxin 1  36.47 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  34.72 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  38.16 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  39.47 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  39.73 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  34.72 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003762  glutaredoxin 1  32.94 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000132582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  39.73 
 
 		 84 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2390  glutaredoxin, GrxA family  35.29 
 
 		 85 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0597  glutaredoxin 1  36.14 
 
 		 87 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  38.36 
 
 		 86 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  35.29 
 
 		 87 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  39.73 
 
 		 84 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  39.73 
 
 		 84 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  38.67 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  35.44 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1641  glutaredoxin 1  34.12 
 
 		 87 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02635  glutaredoxin 1  32.94 
 
 		 88 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 82 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2727  glutaredoxin 1  32.53 
 
 		 89 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0851886  hitchhiker  0.000095879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 85 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.13 
 
 		 88 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  37.33 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  31.58 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  35.9 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  36 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  32.94 
 
 		 88 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  32.94 
 
 		 88 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2030  glutaredoxin 1  32.94 
 
 		 87 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  38.67 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  31.91 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 85 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  40.91 
 
 		 85 aa  52  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  32.56 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 84 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 84 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 85 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 84 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  38.03 
 
 		 85 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  36.14 
 
 		 85 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  36.14 
 
 		 85 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1531  glutaredoxin 1  32.53 
 
 		 85 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247684  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2351  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 104 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2745  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 104 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2364  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283803  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2436  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.904514  normal  0.19606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2525  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0800821  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1789  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2733  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 87 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 84 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  28.87 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1861  glutaredoxin 1  32.53 
 
 		 89 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0977103  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1750  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 86 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1560  glutaredoxin 1  31.76 
 
 		 87 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 85 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>