58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0017 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0035  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  87.88 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0013  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0618011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0027  5S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  44.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  44.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 113 bp  44.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 113 bp  44.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0075  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000486693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0072  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0015  5S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>