55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2079 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.67 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.36 
 
 		 287 aa  141  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.39 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  41.42 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 341 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.36 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.05 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.13 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.29 
 
 		 303 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40 
 
 		 304 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.8 
 
 		 297 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.15 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  25.79 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  25.79 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.8 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.8 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.38 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  29.24 
 
 		 325 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.56 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.13 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  33.13 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.07 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.63 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.28 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.08 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.31 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.68 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  31.88 
 
 		 615 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  31.88 
 
 		 615 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.81 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  31.88 
 
 		 615 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.35 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.68 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  31.44 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.42 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  31.88 
 
 		 617 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.74 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.34 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2087  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.03 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.96 
 
 		 396 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.67 
 
 		 695 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.48 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.18 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.97 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.28 
 
 		 672 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  29.73 
 
 		 271 aa  42  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>