13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1334 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  100 
 
 
596 aa  1184    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  26.49 
 
 
577 aa  143  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  28.79 
 
 
476 aa  90.5  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  26.9 
 
 
409 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  26.87 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  28.45 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  26.22 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  24.24 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  27.84 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  29.2 
 
 
277 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  25.73 
 
 
288 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  24.02 
 
 
393 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 
1057 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>