29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4129 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  100 
 
 		 191 aa  353  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  38.5 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  34.33 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  34.17 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  34.83 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  35.82 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  35.82 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  35.82 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  36.11 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.14 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  31.68 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  38 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  32.5 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  34.69 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  21.33 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  32.93 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  27.67 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  31.19 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  39.13 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  29.06 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  34.34 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24 
 
 		 268 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  33.82 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  31.37 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40.68 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  21.23 
 
 		 262 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>