18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3984 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  832    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  52.08 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  44.32 
 
 		 407 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  32.29 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  29.79 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  29 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  31.82 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  31.61 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  29.03 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  30.86 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  26.88 
 
 		 520 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  27.99 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  29 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  28.82 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  28.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  29.22 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  29.08 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  29.49 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>