More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3474 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  70.56 
 
 		 455 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 441 aa  915    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  67.33 
 
 		 449 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  68.37 
 
 		 443 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  68.06 
 
 		 450 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  66.9 
 
 		 449 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  66.22 
 
 		 449 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  66.51 
 
 		 468 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  66.28 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  65.45 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  67.13 
 
 		 451 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  65.58 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  59.27 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  53.94 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  49.3 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  51.76 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  51.72 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  44.04 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  44.2 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  42.01 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  41.51 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  40.15 
 
 		 421 aa  279  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  38.5 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  39.8 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  39.95 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  38.11 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  38.82 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  38.62 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  40.38 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  38.11 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  39.22 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  40.11 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  38.36 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  39.3 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  39.73 
 
 		 431 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  37.05 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  36.27 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  43.15 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.73 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 337 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.77 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.53 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.54 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 		 339 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.95 
 
 		 346 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 		 341 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.18 
 
 		 342 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 		 332 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.58 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  25.75 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.73 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.3 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.43 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.46 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.16 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.92 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.95 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.19 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.42 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.73 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.97 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.19 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.25 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.71 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.81 
 
 		 341 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.68 
 
 		 332 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.26 
 
 		 332 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  25.26 
 
 		 332 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.9 
 
 		 333 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.28 
 
 		 307 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.87 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.68 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.87 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.42 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>