32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3440 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  41.23 
 
 
293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.78 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  38.94 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  40.38 
 
 
261 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  35.35 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11845  hypothetical protein  31.58 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  33.73 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  32.73 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  32.73 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  32.99 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  30.17 
 
 
503 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  29.17 
 
 
368 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4913  hypothetical protein  30.46 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  33.86 
 
 
399 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  30.19 
 
 
434 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 
381 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  31.18 
 
 
500 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 
372 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  31.47 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  34.03 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.48 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.51 
 
 
696 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.3 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  34.03 
 
 
522 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  32.62 
 
 
500 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  27.66 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  34.95 
 
 
136 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 
384 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>