23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4810 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  100 
 
 
236 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  100 
 
 
236 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  98.73 
 
 
236 aa  463  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  79.61 
 
 
235 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  79.29 
 
 
201 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13699  protease  68.38 
 
 
232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0599341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  45.34 
 
 
221 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.25 
 
 
372 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  30.43 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  27.44 
 
 
522 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4913  hypothetical protein  28.47 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  27.94 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  29.34 
 
 
349 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  29.88 
 
 
496 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  34.65 
 
 
501 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.63 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  30.72 
 
 
399 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  27.91 
 
 
488 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 
378 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  32.21 
 
 
261 aa  42  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>