16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1333 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  40.83 
 
 
261 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  37.79 
 
 
240 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  43.41 
 
 
235 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.18 
 
 
222 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  29.22 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11845  hypothetical protein  26.63 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  29.22 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  34.23 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  34.23 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  34.23 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.93 
 
 
381 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  26.83 
 
 
399 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  27.92 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  28.24 
 
 
434 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>