19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2904 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  99.11 
 
 
224 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  66.67 
 
 
233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  66.22 
 
 
240 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11845  hypothetical protein  56.6 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  41.94 
 
 
227 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  30.73 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  32.32 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  33.11 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5532  hypothetical protein  32.63 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636848  hitchhiker  0.00000458093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 
222 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  31.06 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0197  hypothetical protein  30.06 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  31.96 
 
 
496 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.34 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  27.62 
 
 
236 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>