22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3169 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3169  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187904  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3416  hypothetical protein  81.43 
 
 
240 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0466682  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2860  hypothetical protein  69.9 
 
 
224 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2904  hypothetical protein  69.9 
 
 
224 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685381  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2890  hypothetical protein  69.54 
 
 
224 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11845  hypothetical protein  53.05 
 
 
221 aa  224  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5525  hypothetical protein  42.55 
 
 
227 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269094  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  37.76 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  29.11 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  30.43 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5532  hypothetical protein  30.91 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636848  hitchhiker  0.00000458093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  30.43 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  26.15 
 
 
261 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  30.43 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0197  hypothetical protein  43.86 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.1 
 
 
496 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.63 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  27.23 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  30.6 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  29.51 
 
 
221 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>