52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0238 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  68.13 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  51.16 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  45.12 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  45.35 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  32.84 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  37.35 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  35.06 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1443  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.907457  normal  0.0368823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1790  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  39.39 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  38.81 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  39.34 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  30.95 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  39.34 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  39.34 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  39.34 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15090  Phd_YefM  37.5 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.239627  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3716  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  28.38 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  28.38 
 
 		 74 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  24.05 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  38.89 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  38.46 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  30.99 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  32.47 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  38.81 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>