41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1622 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  714    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  79.21 
 
 		 362 aa  587  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  78.09 
 
 		 360 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  74.58 
 
 		 359 aa  551  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1772  THUMP domain-containing protein  43.06 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.375193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.35 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  35.37 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.43 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.97 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  34.31 
 
 		 184 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  36.05 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  40.51 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  36.47 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.55 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  33.67 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.81 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.07 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.86 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.99 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  35.42 
 
 		 174 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.82 
 
 		 484 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.11 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.23 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.22 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.31 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.82 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  40 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  40 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 482 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  40 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>