45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0107 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0107  cytochrome c prime  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  58.78 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  53.9 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  49.21 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  45.33 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  32.81 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  30.67 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  30.67 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  30 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  30 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  30.16 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  30 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  30 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  33.82 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  28.67 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  35.82 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  28.67 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  28.67 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  35.07 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  30.97 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  26.58 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  34.84 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  27.64 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  30.26 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  30.94 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  28.48 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  31.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  32.06 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  29.69 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  26.98 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  30.07 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  26.67 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  29.53 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  32.31 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  30.15 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  25.32 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  29.53 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  27.39 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  23.97 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  26.17 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  27.91 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  27.91 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  25.48 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0092  hypothetical protein  35 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>