34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1037 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1037  major facilitator transporter  100 
 
 		 366 aa  711    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0279414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0341  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 373 aa  228  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00915727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  23.08 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  21.32 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  20.06 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  22.75 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  22.96 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  23.71 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  23.96 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  23.71 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  23.51 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  23.51 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  23.51 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  23.51 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  19.4 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  23.71 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  23.45 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  20.55 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>