More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2971 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  100 
 
 		 361 aa  705    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  61.16 
 
 		 375 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  58.89 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  59.12 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  53.22 
 
 		 381 aa  341  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  54.7 
 
 		 362 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  57.8 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  54.21 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  41.16 
 
 		 405 aa  312  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.55 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  41.5 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  41.25 
 
 		 403 aa  305  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.89 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  40.3 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  45.84 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  40.7 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  40.66 
 
 		 401 aa  298  8e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  37.76 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44.44 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  37.94 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  37.69 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  35.86 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  40.84 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.94 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  40.85 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.09 
 
 		 404 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  36.11 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  42.16 
 
 		 589 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  37.5 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  36.52 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  36.13 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  36.27 
 
 		 398 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.77 
 
 		 422 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  40.56 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  36.71 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  37.34 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  39 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  36.36 
 
 		 399 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.48 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  37.47 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  42.67 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  36.96 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  47.22 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  38.04 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  39.15 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.47 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  42.33 
 
 		 593 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  35.53 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  34.67 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  42.37 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  45.08 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  43.11 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  37.91 
 
 		 398 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  36.39 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  36 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  41.77 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  38.94 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  48.09 
 
 		 375 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  38.64 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  37.12 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  39.71 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  44.13 
 
 		 408 aa  268  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  38.75 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  37.5 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  35.37 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  44.47 
 
 		 583 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  37.22 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  39.59 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  37.47 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  42.86 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  36.41 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  42.24 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  42.24 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  41.12 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  35.52 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  47.81 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  42.37 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  41.77 
 
 		 417 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  36.46 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  41.93 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.58 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  42.72 
 
 		 420 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  36.34 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  36.62 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  35.86 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  41.64 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  36.62 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  45.48 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  36.5 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  43.35 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  40.76 
 
 		 397 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  36.25 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  36.25 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  36.25 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  36.25 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  42.27 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  36.25 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  42.09 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  43.94 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  38.94 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>