More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1919 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  100 
 
 
361 aa  694    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  60.71 
 
 
375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  59.12 
 
 
361 aa  359  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  56.99 
 
 
358 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  56.18 
 
 
381 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  57.19 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  59.24 
 
 
362 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  43.15 
 
 
397 aa  317  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  43.65 
 
 
404 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  48.45 
 
 
394 aa  315  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.3 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  40.05 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  53.17 
 
 
372 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.01 
 
 
397 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  45.73 
 
 
404 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  42.6 
 
 
405 aa  309  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  49.04 
 
 
405 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.23 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  53.78 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.31 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  43.11 
 
 
405 aa  301  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  40.46 
 
 
397 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  41.48 
 
 
401 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  39.13 
 
 
395 aa  299  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  42.23 
 
 
397 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  42.23 
 
 
397 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  41.97 
 
 
397 aa  297  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  40.3 
 
 
406 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  39.34 
 
 
401 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  52.05 
 
 
381 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  41.71 
 
 
397 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  47.31 
 
 
583 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  37.28 
 
 
404 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  42.03 
 
 
401 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  39.14 
 
 
398 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  45.84 
 
 
593 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  40.7 
 
 
403 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  40.05 
 
 
399 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  37.24 
 
 
397 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  39.14 
 
 
398 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  48.51 
 
 
378 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  40.7 
 
 
403 aa  292  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  40.6 
 
 
405 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  44.56 
 
 
589 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  47.13 
 
 
408 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  39.28 
 
 
398 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  42.39 
 
 
401 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  38.27 
 
 
398 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  39.8 
 
 
406 aa  290  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  46.3 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  38.93 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.79 
 
 
417 aa  288  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  37.76 
 
 
398 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  39.19 
 
 
397 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.39 
 
 
398 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  40.87 
 
 
421 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  39.24 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  43.22 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  46.17 
 
 
395 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  44.36 
 
 
399 aa  285  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  46.92 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  38.38 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  44.39 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.59 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  39.13 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  39.13 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  39.55 
 
 
398 aa  282  5.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  46.45 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  39.69 
 
 
398 aa  281  9e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  37.4 
 
 
394 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.53 
 
 
399 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  39.54 
 
 
397 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  43.41 
 
 
401 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  45.51 
 
 
421 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  50.41 
 
 
371 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  44.47 
 
 
409 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  46.67 
 
 
395 aa  278  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  40.1 
 
 
421 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  39.59 
 
 
421 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  46.58 
 
 
395 aa  277  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  35.7 
 
 
406 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3369  acetate kinase  49.45 
 
 
363 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.564026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  38.83 
 
 
396 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  37.5 
 
 
394 aa  276  6e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  41.62 
 
 
399 aa  275  8e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  38.54 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  39.1 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  44.41 
 
 
421 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  45.51 
 
 
421 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  39.04 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  39.49 
 
 
414 aa  272  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  38.4 
 
 
402 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  38.79 
 
 
402 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  45.72 
 
 
386 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>