More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3545 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  100 
 
 		 433 aa  823    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  57.88 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  49.76 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  57.19 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  58.15 
 
 		 361 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  48.56 
 
 		 375 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  51.93 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  49.41 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  47.07 
 
 		 344 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  47.79 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  40.98 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  47.43 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  36.73 
 
 		 406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  35.54 
 
 		 401 aa  273  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  39.46 
 
 		 589 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  35.7 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  40.27 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  40.27 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  40.56 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  33.63 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  45.51 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  39.07 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  39.45 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  40.33 
 
 		 396 aa  266  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  39.06 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  44.38 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  41.14 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  37.99 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  37.82 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.89 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  38.83 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  45.42 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.83 
 
 		 405 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  42.63 
 
 		 372 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  33.78 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.61 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  47.45 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  47.01 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.61 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.28 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  38.33 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  47.26 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  44.39 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  38.72 
 
 		 397 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  38.94 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  38.66 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  35.41 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  43.1 
 
 		 593 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  36.57 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  38.72 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  40.5 
 
 		 414 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  45.67 
 
 		 583 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  34.97 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  38.67 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  43.45 
 
 		 405 aa  253  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  37.54 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  36.68 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.64 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  38.06 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  39.78 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  45.38 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.47 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  35.25 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  38.1 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  36.67 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  39.45 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  41.07 
 
 		 399 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  43.43 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  36.51 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  37.74 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  40.63 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  40.8 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  35.25 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  40 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  45.96 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  40.8 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  34.31 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  36.07 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  39.55 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  43.18 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  41.97 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  40.66 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  40.93 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  40.93 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  40.93 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  37.46 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  41.62 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  40.27 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  40.27 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  40.27 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  40.27 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  40.27 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>