190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1188 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  74.64 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  72.8 
 
 		 137 aa  189  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  70.21 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  76.92 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  65.12 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  61.94 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  65.6 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  61.02 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  59.68 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  59.83 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  57.26 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  57.5 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  55.46 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  58.47 
 
 		 172 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  54.62 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  54.17 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  53.85 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  52.25 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  50.82 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  53.04 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  52.29 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  45.9 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  48.33 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0199  phenylacetic acid degradation-related protein  49.61 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  47.54 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  47.41 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  47.5 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  45 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  44.88 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  60.47 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  46.28 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  42.86 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  61.63 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  50.88 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  47.41 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  47.83 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  45.61 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  45.61 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  47.83 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  42.02 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  42.02 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  42.02 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  42.02 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  42.02 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  42.02 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  42.02 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  42.02 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  46.67 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  45.3 
 
 		 195 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  44.54 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  43.8 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  46.79 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  43.1 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  49.55 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  49.55 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  49.55 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  49.55 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  44.44 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  41.13 
 
 		 172 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  49.11 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  58.14 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  48.65 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>