39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5015 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  29.41 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  27.59 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 405 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  30.59 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.25 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.35 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0816  hypothetical protein  26.8 
 
 		 719 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0362395  hitchhiker  0.000117327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  28.44 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  29.41 
 
 		 429 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26.25 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.25 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25.51 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>