29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4688 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  487  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  59.85 
 
 
259 aa  299  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  55.64 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  56.42 
 
 
257 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  57.98 
 
 
257 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  57.98 
 
 
257 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  54.47 
 
 
257 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  29.32 
 
 
263 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  34.12 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  32.95 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  31.48 
 
 
270 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  31.78 
 
 
253 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  31.94 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  27.71 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  27.27 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  29.35 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  22.88 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  32.22 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  24.8 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  26 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  24.5 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1992  hypothetical protein  22.59 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.141259  normal  0.0904495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  25.87 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.79 
 
 
292 aa  45.4  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  21.9 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  24.56 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  41.82 
 
 
286 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  28.85 
 
 
275 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>