21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4577 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  100 
 
 		 480 aa  960    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  43.87 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  42.28 
 
 		 444 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  43.8 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  39.52 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  38.43 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  33.5 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  33.48 
 
 		 439 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  40 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  34.74 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  37.58 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  32.38 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  32.28 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  27.63 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  25.4 
 
 		 422 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 784 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  23.89 
 
 		 504 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>