32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2404 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  57.89 
 
 
232 aa  251  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  57.97 
 
 
232 aa  242  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  55.32 
 
 
232 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  55.32 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  43.93 
 
 
230 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  34.93 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  34.93 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  32.68 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  32.65 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  31.51 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  31.69 
 
 
167 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  30.46 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  32.39 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  28.37 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  29.73 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  26.98 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  32.14 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  28.79 
 
 
279 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  22.54 
 
 
280 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  25.23 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  32.65 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  24.6 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  30.12 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  25.76 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.23 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  24.07 
 
 
346 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  28.21 
 
 
265 aa  41.6  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  31.18 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>