23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1855 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  39.08 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  25.74 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  50.94 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  36.78 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  47.17 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  47.17 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  45.28 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  45.28 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  45.28 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  45.28 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  45.28 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  25.52 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  38.27 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  40.7 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  39.66 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  42.86 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  35.71 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  42.86 
 
 
418 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  42.86 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  50 
 
 
659 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  41.54 
 
 
542 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.85 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>