22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0813 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  100 
 
 		 518 aa  1036    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  51.02 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2911  hypothetical protein  32.89 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  26.59 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  26.11 
 
 		 487 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  25.97 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  27.03 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2337  conserved hypothetical protein; putative ribonucleoprotein-related protein  28.52 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0618745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  23.55 
 
 		 508 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3746  hypothetical protein  30.44 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  28.73 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  27.81 
 
 		 542 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  26.23 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  24.77 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  26.23 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  25.96 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  25.83 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  30.77 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  27.44 
 
 		 553 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  21.82 
 
 		 534 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  21.82 
 
 		 534 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  28.16 
 
 		 530 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>