More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0199 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0199  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
305 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0388  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.16 
 
 
308 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0175  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.39 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.42 
 
 
347 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0076  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.13 
 
 
349 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0950  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.31 
 
 
357 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4734  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.61 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4820  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.61 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00201723  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5119  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.29 
 
 
340 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3673  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.85 
 
 
330 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.83 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.36 
 
 
337 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7586  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.7 
 
 
335 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2191  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.63 
 
 
284 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2067  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.29 
 
 
345 aa  158  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.48 
 
 
352 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115682  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0387  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.18 
 
 
339 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1464  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.8 
 
 
327 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.18 
 
 
308 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.667918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.54 
 
 
315 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.58 
 
 
318 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.78 
 
 
240 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2972  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.77 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.74647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.58 
 
 
239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.58 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.77 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.42 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.12 
 
 
238 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.12 
 
 
238 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  31.75 
 
 
240 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2601  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.67 
 
 
299 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.168335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.21 
 
 
240 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.48 
 
 
238 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2852  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.86 
 
 
255 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.95 
 
 
304 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.36 
 
 
319 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.79 
 
 
277 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0961804  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.39 
 
 
240 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0147  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.89 
 
 
302 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.77 
 
 
301 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0638  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.37 
 
 
287 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2470  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.64 
 
 
277 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2310  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.99 
 
 
276 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  31.75 
 
 
240 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  32.12 
 
 
240 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.74 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0996  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0487  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.37 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1005  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.72 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.382859  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.97 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.58 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.49 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.29 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0614299  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2127  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.94 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
263 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.77 
 
 
239 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.1 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.71 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.72 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.19 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.07 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.11 
 
 
600 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.43 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.07 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.41 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.72 
 
 
271 aa  92.4  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.07 
 
 
241 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2661  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.77 
 
 
232 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.518214  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.98 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.76 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.31 
 
 
594 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.03 
 
 
241 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.03 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  28.03 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.03 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.07 
 
 
243 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.51 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.23 
 
 
279 aa  89  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.83 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.39 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.19 
 
 
416 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0435  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.94 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.24 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.91 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.45 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.28 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.18 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  21.03 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.66 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.97 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3495  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.91 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1338  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.61 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.986749  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  24.48 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.8 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.11 
 
 
242 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.13 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.03 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>