59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1950 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1950  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
189 aa  358  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5950  hypothetical protein  75.15 
 
 
186 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0274787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1087  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  68.29 
 
 
169 aa  217  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2103  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.68 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1076  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.68 
 
 
169 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1060  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.68 
 
 
169 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5141  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.81 
 
 
170 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1195  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.81 
 
 
168 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  66.07 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  61.59 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.67 
 
 
185 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2368  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.85 
 
 
184 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2329  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.85 
 
 
184 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2376  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.85 
 
 
184 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00510  hypothetical protein  59.28 
 
 
175 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.798456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  47.19 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.35 
 
 
172 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0227  hypothetical protein  50.3 
 
 
167 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0429  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  50.31 
 
 
167 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0397  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.06 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1869  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  50.31 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.05 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5653  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.78 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.34 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.03 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0203  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase domain-containing protein  47.06 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4104  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.31 
 
 
169 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.16 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  26.49 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  27.45 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.54 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  27.45 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1868  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.22 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.05 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.78 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  39.78 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.7 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
219 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.9 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.17 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.61 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  33.63 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.63 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.95 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30.36 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30.36 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0267  hypothetical protein  28.4 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.73 
 
 
203 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.71 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  28.42 
 
 
204 aa  41.2  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  28.42 
 
 
204 aa  41.2  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>