16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1888 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  828    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  32.16 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  31.71 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  32.23 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1303  hypothetical protein  26.61 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.424505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 930 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  32.47 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.58 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>