More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0813 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  323  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  65.19 
 
 
173 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  64.15 
 
 
167 aa  207  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2014  GCN5-related N-acetyltransferase  60.37 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2627  GCN5-related N-acetyltransferase  66.04 
 
 
159 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  57.05 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  56.41 
 
 
163 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  51.28 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  44.3 
 
 
160 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  50.96 
 
 
165 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  51.66 
 
 
184 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  43.23 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  42.14 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  33.07 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  33.33 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  28.37 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  30 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.55 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0515  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2923  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00907256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2807  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1702  acetyltransferase  35.65 
 
 
160 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0061142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2786  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.113285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2496  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0177281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2868  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1819  acetyltransferase  35.65 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.88 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.97 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
204 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  35.87 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  32.63 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
320 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0084  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7546  putative acetyltransferase protein  32.48 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  33.68 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  30.4 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2240  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  36.07 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.64 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  36.96 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1556  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0661406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
126 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  40 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0081  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0306136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
400 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
414 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
414 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  30.89 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2390  acetyltransferase  35.87 
 
 
282 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0672236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  35.87 
 
 
182 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2579  acetyltransferase, GNAT family  35.87 
 
 
282 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000394368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2566  acetyltransferase  35.87 
 
 
282 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
413 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
413 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11650  sortase-like acyltransferase  48.21 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.359043  normal  0.185087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
414 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  32.09 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>