73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3943 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 179 aa  350  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  95.51 
 
 		 182 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  64.38 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  60.81 
 
 		 152 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  57.43 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.11 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  52.63 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.42 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  30.37 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6551  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000160944  normal  0.118655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  33.67 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.66 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4418  hypothetical protein  80.65 
 
 		 61 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  29.58 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  36.96 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.74 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  33.72 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 364 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2551  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46090  predicted protein  36.99 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 		 382 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4442  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.069585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0370  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.78 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2992  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.07 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.142299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.71 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.78 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.08 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  27.84 
 
 		 143 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 165 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.18 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 368 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  28.57 
 
 		 160 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 320 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 277 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1798  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.04 
 
 		 156 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  28.67 
 
 		 363 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 292 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  30.53 
 
 		 617 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2514  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.04 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.361163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5283  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.41 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  30.22 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.12 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>