80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6035 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  65.54 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.09 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.38 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.11 
 
 		 182 aa  166  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.11 
 
 		 179 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  57.14 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  52.87 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  32.35 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 381 aa  50.8  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.11 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  29.81 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2551  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  27.73 
 
 		 369 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  30.6 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46090  predicted protein  37.29 
 
 		 282 aa  47.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2567  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.19 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.203985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2663  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.19 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1731  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.79 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  23.57 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1798  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2514  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.51 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.361163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.21 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.66 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.21 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0335  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  26.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.75 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0566  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  26.9 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2931  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001601  acetyltransferase  32.94 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3759  GCN5-related protein N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0113  acetyltransferase  27.03 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6026  putative acetyltransferase  28.79 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  25.23 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2560  acetyltransferase  31.58 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.87782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.142299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  38.98 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 320 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.62 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 		 170 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  31.68 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  27.46 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  31.68 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  31.68 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4384  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 215 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0795208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 261 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00870  hypothetical protein  38.1 
 
 		 243 aa  40.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.63 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 277 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2204  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.08 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.11 
 
 		 152 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>