86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0113 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0113  acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  50.28 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354462  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0511  GCN5-related N-acetyltransferase  50.28 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  29.32 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  29.32 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  29.32 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  26.92 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3288  acetyltransferase  27.69 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3546  acetyltransferase  27.69 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0811  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  26.15 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0827  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.622035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3503  acetyltransferase, GNAT family  26.92 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  29.29 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  26.95 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  23.26 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  26.95 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
214 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2249  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0506  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  26.96 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5849  putative acetyltransferase  26.09 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
212 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155744  hitchhiker  0.000000143213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  22.46 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0596  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  23.77 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.611094  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  24.58 
 
 
211 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  29.07 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
201 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  30.11 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3461  GNAT family acetyltransferase  24.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3530  acetyltransferase, GNAT family  24.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3567  GNAT family acetyltransferase  24.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3459  acetyltransferase, GNAT family  24.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3627  acetyltransferase, GNAT family  24.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654924  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4012  acetyltransferase  30.77 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  25.55 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3315  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718101  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0152  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.778253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  26.52 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0635  GCN5-related N-acetyltransferase  22.5 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000069147  unclonable  0.000000000111993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002621  acetyltransferase  26.04 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3454  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02974  hypothetical protein  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03023  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4474  acetyltransferase, GNAT family  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3348  acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3637  acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3450  acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3617  acetyltransferase, GNAT family  26.61 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  27.03 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03385  hypothetical protein  26.04 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  22.41 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4543  GCN5-related N-acetyltransferase  25.96 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110468  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1691  hypothetical protein  22.64 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0148158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0069125  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  21.05 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3171  acetyltransferase  22.62 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0084  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4656  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2918  hypothetical protein  25.85 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.638339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  24.78 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
176 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1620  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  23.96 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.95966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>