27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1840 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 158 aa  316  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.09 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  56.67 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.3 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.3 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  48.98 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  45.95 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  48 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  33.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3759  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.47 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  27.01 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  27.68 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  27.36 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4384  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 		 215 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0795208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  37.1 
 
 		 146 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  30.36 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  29.9 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>