53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3355 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  98.68 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  62.67 
 
 		 175 aa  184  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  62.16 
 
 		 182 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.49 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  61.81 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.67 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.3 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.78 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  30.22 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  33.68 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2551  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  33.11 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  33.11 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  33.11 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 		 268 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  32.43 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3759  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  49.02 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.67 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  33.75 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  34.94 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  31.79 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  32.41 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00870  hypothetical protein  41.27 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46090  predicted protein  28.42 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  32.95 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.58 
 
 		 159 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4874  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  32.34 
 
 		 421 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.07 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6551  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000160944  normal  0.118655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.41 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51345  histone acetyltransferase  37.5 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  28.28 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2898  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.288447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2560  acetyltransferase  35.96 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.87782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 		 154 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  28.57 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>