18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1824 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1824  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  100 
 
 		 157 aa  316  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1840  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.498361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  65.54 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3087  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  63.33 
 
 		 175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.445171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.67 
 
 		 152 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  58.67 
 
 		 152 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4311  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  55.1 
 
 		 182 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3943  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  54.42 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.274484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  50.99 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1523  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  52.56 
 
 		 199 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0641  acetyltransferase  33.55 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000036985  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  29.2 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6551  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000160944  normal  0.118655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  30.52 
 
 		 160 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3382  acetyltransferase, GNAT family  33.85 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>