More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3720 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2918  glutamine synthetase protein  72.03 
 
 		 429 aa  648    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3720  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 429 aa  882    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698416  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2609  glutamate--ammonia ligase  48.59 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.64 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  32.56 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.2 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.79 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  30.21 
 
 		 448 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  32.38 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  31.4 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  34.02 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  29.65 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.62 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  27.9 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.39 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  30.17 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.46 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  31.41 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  29.29 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  28.1 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  29.38 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  28.1 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  30.29 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.45 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  28.06 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  28.99 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  29.43 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  30.12 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  32.16 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  28.37 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  27.53 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  27.53 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  28.71 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  29.31 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  31.32 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  29.31 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  30.17 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  26.19 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  30.22 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  27.64 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  27.19 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  28.4 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  29.31 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.78 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  28.3 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  27.86 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  27.58 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  27.42 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  26.32 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  27.29 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  27.42 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  30.35 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  31.86 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  28.61 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  26.5 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  26.35 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  30.28 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  27.55 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  28.33 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  29.01 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  29.72 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.59 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  29.77 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  28.18 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  28.47 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  27.46 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  26.75 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  28.65 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  26.75 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  27.21 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.88 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.75 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  26.87 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.15 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  30.55 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  30.31 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  29.2 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  31.49 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.72 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  27.97 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>