19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3497 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  35.33 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  33.88 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  78.38 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  61.7 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  61.7 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  60.53 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  36.36 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  32.76 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  45.95 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  45.71 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  35.19 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  48.65 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  31.82 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  32.63 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  38.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  28.17 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  34.29 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>