36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2677 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  100 
 
 		 294 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  40.8 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  39.32 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  27.31 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  33.33 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  37.01 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  36.17 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  24.69 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  27.97 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  27.66 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.83 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  36.59 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  35.29 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  28.07 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  32.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.48 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34.48 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.25 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  28.32 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.47 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  30 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  32.41 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  30.08 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  29.93 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0189  Abortive infection protein  33.93 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0257996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2541  protease  29.17 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>