30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2009 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  48.86 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  43.02 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  44.61 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  43.77 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  41.54 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  39.84 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  35.04 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  37.5 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  34.25 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  26.06 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  29.46 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 433 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 		 409 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 		 415 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 		 409 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  30.22 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>