24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0883 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  283  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  57.14 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  52.86 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  52.86 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  52.82 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  39.44 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  35.62 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  32.65 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  34.01 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  34.42 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  33.12 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  32.67 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  29.29 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  29.29 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  30.87 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  32.61 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  29.33 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  28.67 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  33.8 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>