More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0209 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  63.36 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  60.52 
 
 
255 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  49.03 
 
 
222 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.54 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  49.03 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  49.03 
 
 
228 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  46.08 
 
 
222 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  47.09 
 
 
222 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.12 
 
 
222 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  49.51 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  45.63 
 
 
222 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  49.02 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.71 
 
 
234 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  46.89 
 
 
213 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  45.1 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  48.31 
 
 
208 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  45.85 
 
 
236 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 
235 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  45.89 
 
 
209 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  46.41 
 
 
213 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  45.41 
 
 
209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  41.87 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04380  glutathione S-transferase, putative  41.07 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.276311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  47.52 
 
 
241 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  44.39 
 
 
215 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  44.39 
 
 
215 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  46.36 
 
 
236 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  43.96 
 
 
214 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  44.88 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  45.93 
 
 
208 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  44.39 
 
 
215 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.33 
 
 
234 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  44.39 
 
 
215 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  44.39 
 
 
215 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.66 
 
 
232 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 
231 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  42.51 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  44.39 
 
 
215 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  43.14 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  44.34 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  44.98 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  43.93 
 
 
230 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.2 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  44.76 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  44.76 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  44.39 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.04 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04905  Putative uncharacterized proteinTheta class glutathione S-transferase ;(EC 2.5.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJZ8]  42.92 
 
 
302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0318236  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  43.14 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  42.52 
 
 
230 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.94 
 
 
233 aa  161  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.58 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  45.74 
 
 
234 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  41.26 
 
 
230 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  42.73 
 
 
229 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  40 
 
 
239 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  44.6 
 
 
234 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  45.59 
 
 
211 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  43.78 
 
 
362 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  44.29 
 
 
232 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  44.55 
 
 
234 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  41.67 
 
 
236 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  41.23 
 
 
211 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  42.44 
 
 
235 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 
230 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  42.36 
 
 
227 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  42.51 
 
 
229 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  44.13 
 
 
234 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 
230 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  40.29 
 
 
230 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  43.32 
 
 
234 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.71 
 
 
237 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.15 
 
 
233 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  43.75 
 
 
211 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1948  hypothetical protein  39.8 
 
 
207 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 
231 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.75 
 
 
211 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  39.52 
 
 
233 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>