55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1016 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  62.86 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  47.75 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  46.36 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  46.3 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  46.3 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  42.73 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  51.49 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  37.84 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  47.66 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  43.52 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  47 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  46.3 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  37.96 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  40.2 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  40.37 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  40.19 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  40.37 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  40.19 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  40.19 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  38.32 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  38.32 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  35.78 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  38.68 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  36.46 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  33.65 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  37.38 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  37 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  36 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  41.76 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  33.67 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  30.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  34 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  25.69 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  28.3 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  28.68 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  30.25 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  27.73 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  25.22 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  36.56 
 
 		 136 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 128 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  35 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>