27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0294 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  39.85 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  27.15 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  27.69 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  27.1 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  26.5 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0277  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  28.35 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  29.71 
 
 		 193 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2045  hypothetical protein  25.38 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0106113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  25.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  28.57 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  23.02 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  28.57 
 
 		 227 aa  45.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.43 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 191 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  23.81 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  29.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  28.87 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.13 
 
 		 609 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  26.28 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  28.92 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  29.6 
 
 		 279 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.52 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>