More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2425 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0395  50S ribosomal protein L11  65.73 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00763778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  64.75 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  64.03 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  61.11 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  62.86 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  61.87 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  172  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  172  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 164 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  169  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  64.08 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  61.87 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  57.86 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 143 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  166  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  59.42 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  61.27 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  58.99 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  60 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>